يهدف قسم هندسة الحاسوب إلى تخريج مهندسين يتمتعون بالقدرة على تصميم وتطوير الأنظمة المحوسبة المستندة على استخدام مهارات العتاد لمهندس الكهرباء ومهارات البرمجيات لعالم الحاسوب، والانخراط في الأبحاث الأساسية والتطبيقية لاستكشاف وتطبيق المعرفة الجديدة لتطوير المجتمع ورفعته، إضافةً إلى المساهمة في تطوير تكنولوجيا المعلومات وهندسة الحاسوب في الأردن